Difference between revisions of "Hauptseminar Moderne Simulationsmethoden WS 2009/Polymersimulation"

From ICPWiki
Jump to navigation Jump to search
(added more literature)
 
(8 intermediate revisions by 2 users not shown)
Line 1: Line 1:
−
<setdata>
+
{{Seminartopic
−
date=t.b.a.
+
|date=2009-12-10
−
topic=Polymersimulation: Bond-fluctuation Modell und nicht gittergestützte Simulationen
+
|topic=Polymersimulation
−
speaker=
+
|speaker=Daniel Schmidt
−
tutor=[[Florian Rühle]]
+
|tutor=[[Florian Rühle]]
−
</setdata>
+
}}
−
{{Seminartopic}}
+
 
 +
{{Download|Polymersimulation_Vortrag.pdf|Vortrag}}
 +
{{Download|Polymersimulationen_Ausarbeitung.pdf|Ausarbeitung}}
  
 
== Literatur ==
 
== Literatur ==
Line 16: Line 18:
 
baumgartner79a
 
baumgartner79a
 
</bibentry>
 
</bibentry>
 +
 +
Nicht alle Papers müssen vollständig gelesen werden, obwohl sie viel Interessantes enthalten. Näheres hierzu bei Besprechung mit mir. Auf Nachfrage ist auch noch weiterführende Literatur erhältlich.
 +
 +
== Kurz zum Inhalt ==
 +
 +
Die Simulation von Polymeren hat aufgrund ihrer biologischen Relevanz die Wissenschaft schon immer sehr interessiert. Erste, stark vereinfachte Methoden, konnten die "self avoidance" nicht in Betracht ziehen und das beste, heute immernoch verwendete bond-fluctuation Modell soll im Vortrag vorgestellt werden.
 +
 +
Da heutzutage aber die Rechenleistung stetig zunimmt, muss man sich in Simulationen nicht mehr nur auf rein gittergestützte Modelle beschränken, sondern kann auch ganz allgemein Monte Carlo Simulationen von Polymerbewegungen im Raum simulieren. Auch diese Möglichkeit, ihre Vorteile und ihre Grenzen sollen im Vortrag berücksichtigt werden.
  
 
== Gliederungsvorschlag ==
 
== Gliederungsvorschlag ==
  
 
;1. Was sind Polymere?
 
;1. Was sind Polymere?
 +
 +
* Wofür sind Polymere wichtig
 +
* Aufbau eines Polymers
 +
* Wechselwirkungen
  
 
;2. Notwendige Vereinfachungen
 
;2. Notwendige Vereinfachungen
 +
 +
* Coarse graining
 +
* Diskretisierung in Raum und Zeit
 +
* Bewegungsschemata
  
 
;3. Bond-fluctuation model
 
;3. Bond-fluctuation model
 +
 +
* Probleme von vorhergehenden Modellen
 +
* Idee des Algorithmus
 +
* Anwendungen
  
 
;4. Off-lattice approach
 
;4. Off-lattice approach
 +
 +
* Motivation für off-lattice Simulationen
 +
* Idee des Algorithmus
 +
* Erfolge und Grenzen
 +
 +
== Voraussetzungen ==
 +
 +
Unverzichtbar: Etwas Statistische Physik
 +
 +
Hilfreich: Eine Idee von Monte Carlo Simulationen
 +
 +
[[Category:Hauptseminar WS2009]]

Latest revision as of 12:24, 31 January 2012

"{{{number}}}" is not a number.
Date
2009-12-10
Topic
Polymersimulation
Speaker
Daniel Schmidt
Tutor
Florian Rühle

application_pdf.pngVortrag (695 KB)Info circle.png application_pdf.pngAusarbeitung (312 KB)Info circle.png

Literatur

  • I. Carmesin, K. Kremer.
    The Bond Fluctuation Method: A New Effective Algorithm for the Dynamics of Polymers in All Spatial Dimensions.
    Macromolecules 21(9):2819–2823, 1988.
    [PDF] (585 KB)
  • D. Rigby, B. E. Eichinger.
    Polymer Modeling: Where Has it Been and Where is it Going?
    Macromolecular Symposia 201:47–56, 2003.
    [PDF] (521 KB)
  • K. Binder, A. Milchev.
    Off-lattice Monte Carlo methods for coarse-grained models of polymeric materials and selected applications.
    Journal of Computer-Aided Materials Design 9(1):33–74, 2002.
    [PDF] (752 KB)
  • A. Baumgärtner, K. Binder.
    Monte Carlo studies on the freely jointed polymer chain with excluded volume interaction.
    The Journal of Chemical Physics 71(6):2541–2545, 1979.
    [PDF] (363 KB)


Nicht alle Papers müssen vollständig gelesen werden, obwohl sie viel Interessantes enthalten. Näheres hierzu bei Besprechung mit mir. Auf Nachfrage ist auch noch weiterführende Literatur erhältlich.

Kurz zum Inhalt

Die Simulation von Polymeren hat aufgrund ihrer biologischen Relevanz die Wissenschaft schon immer sehr interessiert. Erste, stark vereinfachte Methoden, konnten die "self avoidance" nicht in Betracht ziehen und das beste, heute immernoch verwendete bond-fluctuation Modell soll im Vortrag vorgestellt werden.

Da heutzutage aber die Rechenleistung stetig zunimmt, muss man sich in Simulationen nicht mehr nur auf rein gittergestützte Modelle beschränken, sondern kann auch ganz allgemein Monte Carlo Simulationen von Polymerbewegungen im Raum simulieren. Auch diese Möglichkeit, ihre Vorteile und ihre Grenzen sollen im Vortrag berücksichtigt werden.

Gliederungsvorschlag

1. Was sind Polymere?
  • Wofür sind Polymere wichtig
  • Aufbau eines Polymers
  • Wechselwirkungen
2. Notwendige Vereinfachungen
  • Coarse graining
  • Diskretisierung in Raum und Zeit
  • Bewegungsschemata
3. Bond-fluctuation model
  • Probleme von vorhergehenden Modellen
  • Idee des Algorithmus
  • Anwendungen
4. Off-lattice approach
  • Motivation für off-lattice Simulationen
  • Idee des Algorithmus
  • Erfolge und Grenzen

Voraussetzungen

Unverzichtbar: Etwas Statistische Physik

Hilfreich: Eine Idee von Monte Carlo Simulationen

Retrieved from "https://www2.icp.uni-stuttgart.de/~icp/mediawiki/index.php?title=Hauptseminar_Moderne_Simulationsmethoden_WS_2009/Polymersimulation&oldid=11347"